MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 3819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	CCA	2	6	270	275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
2	NC_007901	CGA	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885733
3	NC_007901	CGC	2	6	324	329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885733
4	NC_007901	GCT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885733
5	NC_007901	CCA	2	6	453	458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
6	NC_007901	ACA	2	6	468	473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885733
7	NC_007901	CGCA	2	8	475	482	25 %	0 %	25 %	50 %	89885733
8	NC_007901	AATCC	2	10	515	524	40 %	20 %	0 %	40 %	89885733
9	NC_007901	CCAT	2	8	683	690	25 %	25 %	0 %	50 %	89885733
10	NC_007901	TGT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885733
11	NC_007901	GATA	2	8	728	735	50 %	25 %	25 %	0 %	89885733
12	NC_007901	GTC	2	6	824	829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885733
13	NC_007901	ACC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
14	NC_007901	CG	3	6	883	888	0 %	0 %	50 %	50 %	89885733
15	NC_007901	CGT	2	6	957	962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885733
16	NC_007901	AAC	2	6	979	984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885733
17	NC_007901	GCC	2	6	991	996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885733
18	NC_007901	TCC	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885733
19	NC_007901	TCGCC	2	10	1335	1344	0 %	20 %	20 %	60 %	89885733
20	NC_007901	CCT	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885733
21	NC_007901	GGC	2	6	1381	1386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885733
22	NC_007901	ATC	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885733
23	NC_007901	GT	4	8	1472	1479	0 %	50 %	50 %	0 %	89885733
24	NC_007901	GCA	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885733
25	NC_007901	CGC	2	6	1549	1554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885733
26	NC_007901	AG	3	6	1596	1601	50 %	0 %	50 %	0 %	89885733
27	NC_007901	CGT	2	6	1672	1677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885733
28	NC_007901	CGC	2	6	1699	1704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885733
29	NC_007901	CCA	2	6	1721	1726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
30	NC_007901	CCA	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
31	NC_007901	GAAC	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	89885734
32	NC_007901	GTT	2	6	2096	2101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885734
33	NC_007901	GCAA	2	8	2179	2186	50 %	0 %	25 %	25 %	89885734
34	NC_007901	CGGCTA	2	12	2245	2256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89885734
35	NC_007901	TTC	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885734
36	NC_007901	GCC	2	6	2452	2457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885734
37	NC_007901	T	6	6	2459	2464	0 %	100 %	0 %	0 %	89885734
38	NC_007901	TG	3	6	2470	2475	0 %	50 %	50 %	0 %	89885734
39	NC_007901	GTA	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885734
40	NC_007901	CCT	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885734
41	NC_007901	CGA	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885734
42	NC_007901	AACG	2	8	2576	2583	50 %	0 %	25 %	25 %	89885734
43	NC_007901	TCG	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885734
44	NC_007901	TTG	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885734
45	NC_007901	AGC	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885734
46	NC_007901	GC	3	6	2714	2719	0 %	0 %	50 %	50 %	89885734
47	NC_007901	TTC	2	6	2742	2747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885734
48	NC_007901	ATG	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885734
49	NC_007901	ATG	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885734
50	NC_007901	CCA	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885734
51	NC_007901	CCA	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885735
52	NC_007901	CTG	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885735
53	NC_007901	CGC	2	6	3235	3240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885735
54	NC_007901	CT	3	6	3332	3337	0 %	50 %	0 %	50 %	89885735
55	NC_007901	GGCA	2	8	3432	3439	25 %	0 %	50 %	25 %	89885735
56	NC_007901	GTT	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885735
57	NC_007901	GCG	2	6	3470	3475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885735
58	NC_007901	T	6	6	3636	3641	0 %	100 %	0 %	0 %	89885735
59	NC_007901	AGC	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885736
60	NC_007901	CCA	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885736
61	NC_007901	GAA	2	6	3748	3753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885736
62	NC_007901	CCG	2	6	3790	3795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885736
63	NC_007901	TGG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885736
64	NC_007901	GAC	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885736
65	NC_007901	TTCT	2	8	3943	3950	0 %	75 %	0 %	25 %	89885736
66	NC_007901	GAA	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885736
67	NC_007901	CTG	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885736
68	NC_007901	AGA	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885736
69	NC_007901	CCT	2	6	4078	4083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885736
70	NC_007901	ACGA	2	8	4136	4143	50 %	0 %	25 %	25 %	89885736
71	NC_007901	CAA	2	6	4166	4171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885736
72	NC_007901	ATC	2	6	4179	4184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885736
73	NC_007901	GCC	2	6	4280	4285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885736
74	NC_007901	TC	3	6	4315	4320	0 %	50 %	0 %	50 %	89885736
75	NC_007901	CTGT	2	8	4379	4386	0 %	50 %	25 %	25 %	89885736
76	NC_007901	GC	3	6	4412	4417	0 %	0 %	50 %	50 %	89885736
77	NC_007901	ACA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885736
78	NC_007901	ACGA	2	8	4607	4614	50 %	0 %	25 %	25 %	89885736
79	NC_007901	TTGAAT	2	12	4622	4633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	89885736
80	NC_007901	CAT	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885736
81	NC_007901	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885736
82	NC_007901	TGA	2	6	4750	4755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885736
83	NC_007901	AAT	2	6	4781	4786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89885736
84	NC_007901	TTG	2	6	5000	5005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885736
85	NC_007901	GTC	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885736
86	NC_007901	TGC	2	6	5029	5034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885736
87	NC_007901	ACA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885736
88	NC_007901	AAG	2	6	5322	5327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885737
89	NC_007901	GCG	2	6	5351	5356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885737
90	NC_007901	GCA	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885737
91	NC_007901	CTT	2	6	5450	5455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885737
92	NC_007901	TCA	2	6	5484	5489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885737
93	NC_007901	TTC	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885737
94	NC_007901	TGT	2	6	5623	5628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885738
95	NC_007901	AGCG	2	8	5639	5646	25 %	0 %	50 %	25 %	89885738
96	NC_007901	TTG	2	6	5658	5663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885738
97	NC_007901	TGGC	2	8	5742	5749	0 %	25 %	50 %	25 %	89885738
98	NC_007901	CAG	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
99	NC_007901	CGACG	2	10	5894	5903	20 %	0 %	40 %	40 %	89885738
100	NC_007901	ACG	3	9	5901	5909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
101	NC_007901	ATG	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885738
102	NC_007901	TGA	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885738
103	NC_007901	GCA	2	6	6039	6044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
104	NC_007901	ATC	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885738
105	NC_007901	CGC	2	6	6170	6175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885738
106	NC_007901	GCA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
107	NC_007901	TTGT	2	8	6447	6454	0 %	75 %	25 %	0 %	89885738
108	NC_007901	CAT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885738
109	NC_007901	GGC	2	6	6656	6661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885738
110	NC_007901	TGC	2	6	6665	6670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885738
111	NC_007901	CAG	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
112	NC_007901	GGA	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885739
113	NC_007901	GCC	2	6	6850	6855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885739
114	NC_007901	TGG	3	9	6888	6896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885739
115	NC_007901	AGT	2	6	6913	6918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885739
116	NC_007901	CAC	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885739
117	NC_007901	CCGTAC	2	12	6974	6985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89885739
118	NC_007901	GTT	2	6	7000	7005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885739
119	NC_007901	AGG	2	6	7168	7173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885739
120	NC_007901	AAG	2	6	7174	7179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885739
121	NC_007901	TGAT	2	8	7190	7197	25 %	50 %	25 %	0 %	89885739
122	NC_007901	GCA	2	6	7266	7271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885739
123	NC_007901	CTG	2	6	7515	7520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885739
124	NC_007901	GAA	2	6	7698	7703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885739
125	NC_007901	CCG	2	6	7711	7716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885739
126	NC_007901	TG	3	6	7763	7768	0 %	50 %	50 %	0 %	89885739
127	NC_007901	CAG	2	6	7794	7799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885739
128	NC_007901	CGA	2	6	7800	7805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885739
129	NC_007901	GGT	4	12	7856	7867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885739
130	NC_007901	CCG	2	6	7881	7886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885739
131	NC_007901	GCA	2	6	7961	7966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885739
132	NC_007901	GAA	3	9	7999	8007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885739
133	NC_007901	CCT	2	6	8174	8179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885740
134	NC_007901	CCA	2	6	8273	8278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885740
135	NC_007901	CAG	2	6	8397	8402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885740
136	NC_007901	ACTG	2	8	8413	8420	25 %	25 %	25 %	25 %	89885740
137	NC_007901	TGC	2	6	8423	8428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885740
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139	NC_007901	CGA	2	6	8482	8487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885740
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141	NC_007901	TGC	2	6	8621	8626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885740
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143	NC_007901	TGC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885740
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149	NC_007901	GT	3	6	9334	9339	0 %	50 %	50 %	0 %	89885741
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156	NC_007901	GCT	2	6	9633	9638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885741
157	NC_007901	A	6	6	9645	9650	100 %	0 %	0 %	0 %	89885741
158	NC_007901	CCGG	2	8	9924	9931	0 %	0 %	50 %	50 %	89885742
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162	NC_007901	TTG	2	6	10181	10186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885742
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253	NC_007901	AAT	2	6	14828	14833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89885745
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265	NC_007901	ATT	2	6	15067	15072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89885746
266	NC_007901	TCA	2	6	15099	15104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885746
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